離子交換色譜有著較為廣泛的應用所在，例如：應用于水處理，分離與純化小分子物質，分離與純化生物大分子物質等等。當然對于人們而言，在進行使用時，為了將相關效能更好發揮出來，還應當要明確基本定義與工作原理。它主要是指，離子交換色譜當中，固定相的一些帶電荷的基團。離子交換分離色譜的關鍵在于，要控制樣品離子與流動相離子，對固定相表面電荷位置的競爭作用。為了較好的分離條件，應當要控制相關選擇。離子交換型的類型，流動相的PH，流動相中的配對離子類型，流動相的離子強度等等。

目前在整個市場上，離子交換色譜的類型相對較多。不同的類型，相應的應用領域往往會有所不同。在進行使用的時候，明確相關操作模式，相對而言就顯得尤為重要。較為常用的方法，主要是填充床色譜，是將離子交換劑填充在一個柱子中，顆粒之間只有較小的間隙體積。由于樣占占中的顆粒物質，會阻塞介質顆粒間的小通道，因而樣品要在上離子交換柱前，進行相應的澄清處理。之所以要這樣做，主要的目的在于，避免柱子堵塞，降低相應的流速。使用較大顆粒的介質，在某種程度上可以減少相關問題的出現。

擴張床色譜主要是指，利用吸附劑的密度分布，在頂部安裝有高度調節器，相互之間的空隙會增大，床層壓降較低，能夠允許料液中細胞等固體顆粒通過。在這個過程當中，目的產物不能通過分離澄清，而是直接從含微顆粒的粗品原理中純化。與此同時，還有頂替色譜操作模式，它主要是使用了終端置換劑。在對電感耦合等離子體進行使用時，同樣要明確相關工作原理。